Роспотребнадзор: в российской базе геномов коронавируса накопилось 90 тыс. записей
На данный момент в базе данных VGARus (российская база геномов коронавируса) почти 90 тыс. записей, треть из них появилась в 2022 году. Об этом "Газете.Ru" рассказали в Роспотребнадзоре.
Особенно внимательно специалисты следят за разными линиями "омикрона", для чего специалисты ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора разработали новую методику. Особые опасения вызывает "омикрон" линии BA.2, который также называют "невидимкой".
"В нем отсутствует генетическая делеция двух аминокислот в шиповидном белке - части вируса, которая помогает вирусу проникнуть в клетки человека, - объяснил руководитель научной группы разработки новых методов диагностики на основе технологий секвенирования ЦНИИ эпидемиологии Роспотребнадзора Камиль Хафизов. - Собственно, эта мутация и использовалась многими зарубежными ПЦР-тестами для того, чтобы детектировать штамм "омикрон", отличая его от "дельты". А тут получилось, что как бы и "омикрон", но делеции нет, и потому тесты промахивались".
По словам Хафизова, секвенирование генома вируса гарантированно выявляет все изменения в нуклеотидной последовательности патогена, и в таком случае ошибки практически исключены.
В июне 2021 года по распоряжению правительства РФ в ЦНИИ Эпидемиологии была разработана и введена в действие платформа "VGARus (Virus Genome Aggregator of Russia). База данных "VGARus" содержит информацию о нуклеотидных последовательностях вариантов SARS-CoV-2 и их мутациях, распространенных в тех или иных регионах РФ, и может быть использована для хранения, систематизации и выборки данных для выявления мутаций и определения штаммов вирусов. Данная платформа при необходимости может быть использована как база для мониторинга за другими инфекциями.